La FMS est gérée par une direction du décanat qui comprend le doyen, le vice-doyen qui est le directeur des études, le directeur de stage et le conseil scientifique de la faculté. Elle comprend aussi les directions de recherche médicale (DRM), évaluation clinique objective standardisée (ECOS), de la pédagogie, intégration des technologies d’information et de communication (ITIC), du troisième cycle, d’évaluation des pratiques médicales et de la formation continue, d’évaluation des parcours et direction de la simulation et des comités de planification stratégique, de qualité, d’accréditation, des thèses, de tutorat, d’écoute, d’éthique, de soins infirmiers, d’anglais, de la bibliothèques, de culture, de médecine de famille, de tutorat des étudiants, de préparation des thèses, des activités sportives, d’organisation de l’examen classant national et le comité de préparation de l’examen classant national, et de deux commissions doctorales (Figure 12).
Figure 12 : Organigramme de la faculté de médecine de Sfax