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Elle est située en plein centre ville, juste en face des deux hôpitaux universitaires, elle couvre un terrain de 12000 m2 dont 3500 aménagés en espaces verts. La surface couverte est de 27000 m2. Au fil des années, elle s'est dotée d'une infrastructure comportant six amphithéâtres d'une capacité de 130 à 350 étudiants, d'une bibliothèque comportant une salle de lecture de 350 places, de 12 laboratoires d'enseignement et de recherche, d'une médiathèque, d'une salle d'enseignement d'informatique médicale et d'une salle d'auto apprentissage. Un réseau Intranet relie les différentes structures de la Faculté qui est connectée au réseau Internet par une ligne spécialisée.
 
La faculté de médecine de Sfax est dotée de 6 amphithéâtres et 8 salles d’enseignement selon le tableau suivant :

Nom
localisation
Nombre de places
équipement audiovisuel
G1
Rez-de chaussé
35
Oui
G2
Rez-de chaussé
35
Oui
G3
Rez-de chaussé
35
Oui
F2
Tour
35
Oui
F3
Tour
35
Oui
F4
Tour
35
Oui
F5
Tour
35
Oui
Salle d’anatomie
1st flour
35
Oui
Amphithéatre  1
Rez-de chaussé
150
Oui
Amphithéatre 2
Rez-de chaussé
150
Oui
Amphithéatre 3
Rez-de chaussé
180
Oui
Amphithéatre 4
Rez-de chaussé
180
Oui
Amphithéatre 5
Rez-de chaussé
180
Oui
Amphithéatre 6
Rez-de chaussé
380
Oui

 Elle comporte aussi 13 laboratoires d’enseignement et de recherche : Anatomie, Anatomie pathologique, Biophysique, Physiologie, Biophysique, Biochimie, microbiologie, parasitologie, histologie, hématologie, génétique, pharmacologie, médecine préventive.

 Pour l’enseignement pratique, la faculté de médecine de Sfax est annexée à deux grands centres hospitalo-universitaires (CHU Habib Bourguiba et CHU Hedi Chaker), mais aussi à d’autres hôpitaux universitaires : Hôpital régional de Gabes, Hôpital Habib Bourguiba de Médenine, Hôpitaux régionaux de Mahres, Jebeniana, Kerkena, Bir Ali)

 Elle est dotée d’une bibliothèque avec espace de lecture en 2 étages sur une surface de 748.5 m², pour 300 étudiants. Elle est ouverte de 8h du matin à 18h le soir du lundi au vendredi et de 7h30 à 13h 30 le samedi. Ces horaires sont étendus durant les périodes de révision et d’examen. La bibliothèque équipé de 24857 volumes (livres et périodiques et toutes les thèses en médecine soutenues dans les 4 facultés de médicine de la Tunisie. Durant ces dernières années, nous avons adopté une stratégie favorisant les ressources électroniques ; nous avons accès à 9 ressources électroniques en full text (science direct, EMC, HINARI, SPRINGER, JSTOR, WILEY, SCOPUS, Thomson Reuters –Essential Science Indicators (ESI), Thomson Reuters – Journal Citation Reports (JCR)

La bibliothèque comporte aussi une salle comportant 30 ordinateurs pour les étudiants et une salle dédiée aux enseignants et équipée d’ordinateurs (10 places), qui permettent un accès aux différentes collections électroniques de la librairie, avec un photocopieur à coté.

Une salle pour la soutenance de thèses, (250 m2, 100 places), une salle de réunions et une salle de videoconference, avec unité mobile et ISDN ou IP.

Il y a aussi une buvette et un large espace de loisir en face de la buvette.

Les espaces pour activités sportives comportent un terrain de foot-ball gazonné et un terrain de basket-ball.

Le bloc administratif est fait sur deux étages et comprend les bureaux de scolarité, des stages, de finance etc…